Jonathan Kaplan (né le 25 novembre 1947) est un producteur et réalisateur américain.
Son film The Accused (1988) a valu à l'actrice Jodie Foster son premier Oscar de la meilleure actrice et a été nominé pour l'Ours d'or au 39e Festival international du film de Berlin.
Kaplan a reçu 5 nominations aux Emmy pour ses rôles de metteur en scène et producteur d'Urgences.